MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 54270

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_015850	GCT	2	6	234270	234275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780968
4003	NC_015850	CCAG	2	8	234296	234303	25 %	0 %	25 %	50 %	340780968
4004	NC_015850	TGCC	2	8	234381	234388	0 %	25 %	25 %	50 %	340780968
4005	NC_015850	TGCC	2	8	234397	234404	0 %	25 %	25 %	50 %	340780968
4006	NC_015850	AGGC	2	8	234428	234435	25 %	0 %	50 %	25 %	340780968
4007	NC_015850	CGTG	2	8	234499	234506	0 %	25 %	50 %	25 %	340780968
4008	NC_015850	CGA	2	6	234520	234525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780968
4009	NC_015850	CCA	2	6	234540	234545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340780968
4010	NC_015850	GCT	2	6	234598	234603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780968
4011	NC_015850	GGC	2	6	234623	234628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780968
4012	NC_015850	TAGC	2	8	234700	234707	25 %	25 %	25 %	25 %	340780968
4013	NC_015850	GC	3	6	234781	234786	0 %	0 %	50 %	50 %	340780968
4014	NC_015850	CGAG	2	8	234806	234813	25 %	0 %	50 %	25 %	340780968
4015	NC_015850	GAT	2	6	234823	234828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340780968
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4017	NC_015850	TGC	2	6	234974	234979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780969
4018	NC_015850	TGT	2	6	235061	235066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340780969
4019	NC_015850	CGA	2	6	235109	235114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780969
4020	NC_015850	TC	3	6	235121	235126	0 %	50 %	0 %	50 %	340780969
4021	NC_015850	ATC	2	6	235206	235211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340780969
4022	NC_015850	CAA	2	6	235259	235264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340780969
4023	NC_015850	TGC	2	6	235301	235306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780969
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4030	NC_015850	TGC	2	6	235633	235638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780969
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4033	NC_015850	GCGA	2	8	235739	235746	25 %	0 %	50 %	25 %	340780969
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4036	NC_015850	GAT	2	6	235869	235874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340780969
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4104	NC_015850	GAG	2	6	238958	238963	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340780970
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4243	NC_015850	CCA	2	6	246122	246127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340780978
4244	NC_015850	GC	3	6	246159	246164	0 %	0 %	50 %	50 %	340780978
4245	NC_015850	TCC	2	6	246190	246195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340780978
4246	NC_015850	GCA	2	6	246245	246250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780978
4247	NC_015850	CAC	2	6	246278	246283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340780978
4248	NC_015850	GAG	2	6	246285	246290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340780978
4249	NC_015850	GGC	2	6	246294	246299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780978
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4253	NC_015850	GTG	2	6	246361	246366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340780978
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4260	NC_015850	GCG	2	6	246867	246872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780979
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4263	NC_015850	CGG	2	6	247210	247215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780979
4264	NC_015850	ATGC	2	8	247265	247272	25 %	25 %	25 %	25 %	340780979
4265	NC_015850	GAC	2	6	247352	247357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780979
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4267	NC_015850	CGG	2	6	247427	247432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780979
4268	NC_015850	GCT	2	6	247453	247458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780979
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4273	NC_015850	G	6	6	247787	247792	0 %	0 %	100 %	0 %	340780980
4274	NC_015850	GA	3	6	247850	247855	50 %	0 %	50 %	0 %	340780980
4275	NC_015850	CCG	2	6	247902	247907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340780980
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4281	NC_015850	GAC	2	6	248182	248187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780980
4282	NC_015850	GGA	2	6	248237	248242	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340780980
4283	NC_015850	CGT	2	6	248297	248302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780980
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4287	NC_015850	GA	3	6	248473	248478	50 %	0 %	50 %	0 %	340780980
4288	NC_015850	TCA	2	6	248494	248499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340780980
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4303	NC_015850	CGAT	2	8	249604	249611	25 %	25 %	25 %	25 %	340780981
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4309	NC_015850	AGGC	2	8	249815	249822	25 %	0 %	50 %	25 %	340780981
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4315	NC_015850	CAG	2	6	250014	250019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780981
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4322	NC_015850	GTG	2	6	250321	250326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340780982
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4332	NC_015850	CAG	2	6	250726	250731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780983
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4339	NC_015850	CTG	2	6	251119	251124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780983
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4349	NC_015850	ACG	2	6	251615	251620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780984
4350	NC_015850	GCC	2	6	251808	251813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340780984
4351	NC_015850	ATC	2	6	251839	251844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340780984
4352	NC_015850	ATCCCG	2	12	251848	251859	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	340780984
4353	NC_015850	ATG	2	6	251885	251890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340780984
4354	NC_015850	TTC	2	6	251950	251955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340780985
4355	NC_015850	GTCG	2	8	251976	251983	0 %	25 %	50 %	25 %	340780985
4356	NC_015850	AGGA	2	8	251999	252006	50 %	0 %	50 %	0 %	340780985
4357	NC_015850	GCA	2	6	252048	252053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780985
4358	NC_015850	GCG	2	6	252095	252100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780985
4359	NC_015850	CTT	2	6	252145	252150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340780985
4360	NC_015850	GCC	2	6	252202	252207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340780985
4361	NC_015850	ATC	2	6	252239	252244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340780985
4362	NC_015850	GCTC	2	8	252255	252262	0 %	25 %	25 %	50 %	340780985
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4488	NC_015850	CTG	2	6	257588	257593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780990
4489	NC_015850	CGA	2	6	257626	257631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780990
4490	NC_015850	GCG	2	6	257643	257648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780990
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